以下のようなコマンドでC:\hoge\fugaのペインは開けますが、反対ペインの最前面には出てきません。
何か方法はあるでしょうか？
C:\path\to\PPCW.EXE -pane:~ -noactive "C:\hoge\fuga"

fenrirで反対ペインのディレクトリを変更して、そこにコピーするというようなことをやろうとしています。

-selectnoactive を使えばよさそうです。

ありがとうございます！できました。