PPx Customizer で以下の設定にした後、左側のペインで q を押すと、
1ペインにならずにウィンドウが閉じてしまいます。

「複数PPcを一体化させ、1ウィンドウにする」チェック
「起動時のペイン数」2

閉じるだけならば支障はないのですが、ホットキーでアクティブに
する設定をしている場合には、これが効かなくなるようです。
修正していただければ幸いです。

PPx: 1.53+1 64bit
OS: Windows10 64bit

こちらでも再現できました。
前の時に再現できなかったのは、起動時に最初に開くペインを
最初に閉じることが重要だったからのようですね。
条件の特定ありがとうございます。
併せてホットキーで開かない件も確認しました。
どちらの件についても対処します。

調べたところ、終了時に異常終了するケースも見つかったので、
まとめて修正し、先程+2を公開しました。こちらを使ってください。

修正ありがとうございます！
解消していることを確認しました。

ようやく対処できて良かったです。