独立窓で使用時に *ppc -r -bootid:~ で反対窓が既にある場合はアクティブになるという動作が機能してないみたいです。-bootid:A という風にIDを指定すると機能します。Version 1.85までは -bootid:~ という指定の仕方でも機能していました。
1.85以降の調整が完全でなかったようで色々問題が出ています。指摘頂いた問題をこちらでも確認しました。次版で修正します。それまでは ppc -r -k *focus ~ で同等の動作になりますので前記指定を使ってください。