2.08 では、ペインを増やしたときのペイン幅を以前の幅になるように調整したので、それが影響しているかもしれませんね。ただ、こちらでは、終了→起動を繰り返しても区切り位置が変化していません。調べてみたいので、タブ周りの設定(X_combos, X_combou, X_mpane)を教えてもらえませんか。